13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_R0054 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.875757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0010  tRNA-Leu  98.82 
 
 		 85 bp  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.102208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0052  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0025  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000312585  hitchhiker  0.0000000105189 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581648  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0025  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0221479  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0039  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>