108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_R0001 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.761083  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309198  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.439755  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0786  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  79.8  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0088  tRNA-Leu  89.23 
 
 
86 bp  73.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0040  tRNA-Leu  94.74 
 
 
89 bp  60  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0858293  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0057  tRNA-Leu  94.59 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu01  tRNA-Leu  94.59 
 
 
92 bp  58  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0020  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0035  tRNA-Leu  94.59 
 
 
88 bp  58  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  94.44 
 
 
89 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0043  tRNA-Leu  94.44 
 
 
88 bp  56  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000409272  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1756  tRNA-Leu  94.44 
 
 
89 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1979  tRNA-Leu  94.44 
 
 
89 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1544  tRNA-Leu  94.44 
 
 
86 bp  56  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  56  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  56  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0009  tRNA-Leu  94.29 
 
 
88 bp  54  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.207835  normal  0.0298119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0067  tRNA-Leu  94.29 
 
 
86 bp  54  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50283  hitchhiker  0.00109765 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0031  tRNA-Leu  92.11 
 
 
86 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0058  tRNA-Leu  92.11 
 
 
89 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000059003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0022  tRNA-Leu  92.11 
 
 
86 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106593  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0069  tRNA-Leu  92.11 
 
 
86 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00338367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0103  tRNA-Leu  92.11 
 
 
86 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.937736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0019  tRNA-Leu  92.11 
 
 
86 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0079  tRNA-Leu  92.11 
 
 
86 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3261  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.733644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3263  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3266  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1224  tRNA-Leu  90 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0795794  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0027  tRNA-Leu  90 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0171  tRNA-Leu  90 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.661922  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0063  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000700338  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02743  tRNA-Leu  91.67 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05676  tRNA-Leu  91.67 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05682  tRNA-Leu  91.67 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0022  tRNA-Leu  90 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0036  tRNA-Leu  90 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0039  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000720687 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07695  tRNA-Leu  91.67 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3171t  tRNA-Leu  91.67 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0569623  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3174t  tRNA-Leu  91.67 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000836085  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna121  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000362621  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna003  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00119641  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna005  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.240407  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0019  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131414  normal  0.290312 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0036  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.798802  normal  0.436937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41320  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73657  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0003  tRNA-Leu  91.43 
 
 
92 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0034  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.670287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0063  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.381313  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3504  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0046  tRNA-Leu  96.3 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531396  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0032  tRNA-Leu  96.3 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00166696  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1159  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141825  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0016  tRNA-Leu  91.43 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.460002  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0025  tRNA-Leu  91.43 
 
 
92 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0005  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  89.47 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000637838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  89.47 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  89.47 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  89.47 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0596776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA33  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.962701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R53  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0125936  normal  0.289894 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.5451e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0029  tRNA-Leu  92.11 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49401  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0679  tRNA-Leu  89.47 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2790  tRNA-Leu  89.47 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000401538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2793  tRNA-Leu  89.47 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000950853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2796  tRNA-Leu  89.47 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000297688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0677  tRNA-Leu  89.47 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2476  tRNA-Leu  89.47 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00963424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2479  tRNA-Leu  89.47 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100128  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2482  tRNA-Leu  89.47 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028015  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2169  tRNA-Leu  89.47 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00848562  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07705  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0178  tRNA-Leu  89.47 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0008  tRNA-Leu  89.47 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0047  tRNA-Leu  89.47 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00091084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0044  tRNA-Leu  89.47 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167859  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0013  tRNA-Leu  89.47 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000293316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0057  tRNA-Leu  89.47 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0013  tRNA-Leu  89.47 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000427747  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0057  tRNA-Leu  89.47 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.583439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0062  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163456  normal  0.0301786 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0066  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0822521 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0024  tRNA-Leu  89.47 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000298281  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.0213265 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0015  tRNA-Leu  89.47 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000127557  hitchhiker  0.00355692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0056  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000684765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000344559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0075  tRNA-Leu  89.47 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000629352  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0026  tRNA-Leu  89.47 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60230  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>