20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_R0020 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.255159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0019  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 84 bp  143  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0024  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 84 bp  111  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.1252  hitchhiker  0.00000142031 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0002  tRNA-Ser  91.76 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.302196  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0068  tRNA-Ser  90.59 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.802658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0008  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0047  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.363749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0026  tRNA-Ser  90 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141177  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0053  tRNA-Ser  85.88 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0026  tRNA-Ser  89.8 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0150471  normal  0.143163 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0026  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1100  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000893651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.191845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0527771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1722  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0606  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-1  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0176232  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0040  tRNA-Ser  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.412277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0069  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.980326  normal  0.628883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>