More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1722 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE_tRNA-Met-1  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1722  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1100  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000893651  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0606  tRNA-Met  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0012  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  93.7  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0040  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  93.7  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318814  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAMetVIMSS1309263  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  93.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105935 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAMetVIMSS1309377  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  93.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00798098  hitchhiker  0.0000123944 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0023  tRNA-Met  97.87 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22048  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAMetVIMSS1309167  tRNA-Met  97.87 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2163  tRNA-Met  93.44 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.214808  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2250  tRNA-Met  93.44 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0455  tRNA-Met  94.64 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00135587  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAMetVIMSS1309108  tRNA-Met  97.67 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0034  tRNA-Met  94.12 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0035  tRNA-Met  97.62 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0039  tRNA-Met  97.62 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.788311  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3280  tRNA-Met  95.35 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3281  tRNA-Met  95.35 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3282  tRNA-Met  95.35 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3283  tRNA-Met  95.35 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3284  tRNA-Met  95.35 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3285  tRNA-Met  95.35 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt019  tRNA-Met  95.35 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00289748  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0003  tRNA-Met  95.35 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00215026  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1453  tRNA-Met  97.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAMetVIMSS1309196  tRNA-Met  95.35 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.868171  hitchhiker  0.00000970855 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0024  tRNA-Met  95.35 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264757  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0083  tRNA-Met  95.35 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000703171  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0075  tRNA-Met  95.35 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.928415 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0076  tRNA-Met  95.35 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0077  tRNA-Met  95.35 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0051  tRNA-Met  95.24 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0633  tRNA-Met  95.24 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.00000000739177  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-1  tRNA-Met  95.24 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-2  tRNA-Met  95.24 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0011  tRNA-Met  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0018  tRNA-Met  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00237238  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0045  tRNA-Met  95.24 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00820009  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0036  tRNA-Met  95.24 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0048  tRNA-Met  95.24 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0036  tRNA-Met  95.24 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106815  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0048  tRNA-Met  95.24 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.726502  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0018  tRNA-Met  95.24 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0025  tRNA-Met  95.24 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0009  tRNA-Met  97.62 
 
 
72 bp  67.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0017  tRNA-Met  95.24 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.655239  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0026  tRNA-Met  95.24 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000815309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0048  tRNA-Met  95.12 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00409102  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0049  tRNA-Met  93.88 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0034  tRNA-Met  93.88 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168709  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0002  tRNA-Met  95.12 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.594163  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07715  tRNA-Met  95.12 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.461139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-3  tRNA-Met  100 
 
 
80 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000174152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-3  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000104946  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0089  tRNA-Met  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014219  hitchhiker  0.00718403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0042  tRNA-Met  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00068414  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0093  tRNA-Met  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0094  tRNA-Met  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0095  tRNA-Met  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0096  tRNA-Met  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0097  tRNA-Met  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0074  tRNA-Met  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0141721  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0089  tRNA-Met  90 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0014  tRNA-Met  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000138583  hitchhiker  0.00843441 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tMet03  tRNA-Met  94.87 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0053  tRNA-Met  97.44 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0058  tRNA-Met  94.87 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0041  tRNA-Met  94.87 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000116747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0093  tRNA-Met  94.87 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.482828  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0041  tRNA-Met  97.44 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0032  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0019  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.69794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0042  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0290864  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0036  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706305  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0037  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306367  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0038  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.161096  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0094  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19946  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0019  tRNA-Met  100 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0035  tRNA-Met  100 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.906537  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0018  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.721782  hitchhiker  0.000298186 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4213  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.355481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4214  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4276  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0036  tRNA-Met  100 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.784357  normal  0.0160013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0053  tRNA-Met  100 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307129  normal  0.0211178 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00100  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00104  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00106  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03399  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4693  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4694  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4695  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4696  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>