More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_R0041 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_R0041  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-2  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0970138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0042  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0290864  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0053  tRNA-Met  97.14 
 
 		 72 bp  123  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0014  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0018085  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Met-3  tRNA-Met  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0037  tRNA-Met  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1097  tRNA-Met  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0009  tRNA-Met  100 
 
 		 72 bp  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0025  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0024  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0028  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000365135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0058  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407746  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0064  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00167035  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0006  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000568844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0005  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0048  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00409102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0224  tRNA-Met  92.21 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000093753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5037  tRNA-Met  92.21 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.794581  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0070  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  92.21 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  92.21 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  92.21 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  92.21 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0011  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0018  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00237238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0082  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000739583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5049  tRNA-Met  92.21 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0057  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000630751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0081  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000214937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0131  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0060  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0090  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419074  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0070  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0071  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957172  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0058  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4566  tRNA-Met  92.21 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  0.0841904 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  92.21 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0089  tRNA-Met  96.49 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0029  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0041  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000116747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0093  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.482828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0009  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0529  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1797900000000004e-29 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0604  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5667  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5675  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000376256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5699  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000350684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-2  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0182265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-7  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-3  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00436106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-4  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-6  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00001255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-2  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0383767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-3  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000267735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-8  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0109  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000630943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5678  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5710  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-2  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.527253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0018  tRNA-Met  93.55 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-4  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000768608  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0027  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0920329  hitchhiker  0.000285559 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0865  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000813952  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0306  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5737  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5667  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000879492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5807  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00231597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4773  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000665438  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0282  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0790  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3991e-32 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0036  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465493  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0019  tRNA-Met  93.44 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0053  tRNA-Met  93.44 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307129  normal  0.0211178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0036  tRNA-Met  93.44 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.784357  normal  0.0160013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0035  tRNA-Met  93.44 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.906537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0083  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0005  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.208114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0014  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000138583  hitchhiker  0.00843441 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2478  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00948036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2481  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000303707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>