More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_R0032 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_R0032  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0004  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000171027  normal  0.958978 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0028  tRNA-Met  94.67 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0051  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0018  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0017  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.655239  normal 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-2  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0970138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t029  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t030  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4588  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0633  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.811273  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0078  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0079  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0078  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0634809  normal  0.33041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0079  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.060888  normal  0.335766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52320  tRNA-Met  93.75 
 
 
74 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1572  tRNA-Met  91.67 
 
 
74 bp  95.6  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1598  tRNA-Met  91.67 
 
 
74 bp  95.6  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050926  normal  0.567134 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1607  tRNA-Met  91.67 
 
 
74 bp  95.6  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.836309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0064  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00167035  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0074  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291778  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0075  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188709  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0076  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.195191  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0014  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0018085  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0044  tRNA-Met  93.75 
 
 
74 bp  95.6  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0042  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0290864  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0038  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0258342  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00110  tRNA-Met  93.65 
 
 
74 bp  93.7  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0066  tRNA-Met  93.65 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.508112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t20  tRNA-Met  93.65 
 
 
74 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t21  tRNA-Met  93.65 
 
 
74 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.929241  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t22  tRNA-Met  93.65 
 
 
74 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0037  tRNA-Met  93.65 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306367  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00106  tRNA-Met  93.65 
 
 
74 bp  93.7  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0038  tRNA-Met  93.65 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.161096  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0087  tRNA-Met  93.65 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0085  tRNA-Met  93.65 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248101  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  96.36 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0036  tRNA-Met  93.65 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706305  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0035  tRNA-Met  93.65 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0039  tRNA-Met  93.65 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.788311  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0086  tRNA-Met  93.65 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325929  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0067  tRNA-Met  93.65 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3280  tRNA-Met  97.96 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3281  tRNA-Met  97.96 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3282  tRNA-Met  97.96 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3283  tRNA-Met  97.96 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3284  tRNA-Met  97.96 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3285  tRNA-Met  97.96 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0031  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169979  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0045  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0045  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0080  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654019  normal  0.0862038 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2751  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.74519e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t71  tRNA-Met  92.19 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0872657  hitchhiker  0.00727048 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-1  tRNA-Met  90.28 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-2  tRNA-Met  90.28 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0107  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0531774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0083  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208848  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0082  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0195288  normal  0.0518693 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0048  tRNA-Met  90.28 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0090  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0101  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.893911  decreased coverage  0.00145589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0100  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.925668  decreased coverage  0.00140231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0005  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.098649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5465  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.239722  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0048  tRNA-Met  90.28 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.726502  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet01  tRNA-Met  92.19 
 
 
80 bp  87.7  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62790  tRNA-Met  92.19 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0021  tRNA-Met  90.28 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.114788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0091  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0102  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.872773  hitchhiker  0.00341362 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0099  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.69188  decreased coverage  0.00129939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0098  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.514232  decreased coverage  0.00128262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0093  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0092  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0108  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0112  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0096  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0036  tRNA-Met  90.28 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0036  tRNA-Met  90.28 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382466  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0037  tRNA-Met  92.19 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0094  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19946  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0110  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0138501  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60270  tRNA-Met  92.19 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60370  tRNA-Met  92.19 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2749  tRNA-Met  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000330212  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  92.06 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  92.06 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  92.06 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t53  tRNA-Met  92.06 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t54  tRNA-Met  92.06 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.243475  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  92.06 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  92.06 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA21  tRNA-Met  92.06 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.929438  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0036  tRNA-Met  92.06 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0037  tRNA-Met  92.06 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0076  tRNA-Met  92.06 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0077  tRNA-Met  92.06 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0076  tRNA-Met  92.06 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0631311  normal  0.3321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>