More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_R0064 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_R0064  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00167035  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0005  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0970138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0014  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0018085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0042  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0290864  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0061  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0041  tRNA-Met  93.51 
 
 		 75 bp  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0018  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00237238  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0002  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0002  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0004  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000171027  normal  0.958978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0024  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0028  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0058  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407746  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000365135 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0006  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000568844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5465  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.239722  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60270  tRNA-Met  93.75 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0032  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62790  tRNA-Met  93.75 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0045  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207036  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60370  tRNA-Met  93.75 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0034  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0131764 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0053  tRNA-Met  91.89 
 
 		 72 bp  93.7  6e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-1  tRNA-Met  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0039  tRNA-Met  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0036  tRNA-Met  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0048  tRNA-Met  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0036  tRNA-Met  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106815  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0048  tRNA-Met  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.726502  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0018  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.721782  hitchhiker  0.000298186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0019  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0020  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000296259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0021  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0022  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0023  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031593 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Met-3  tRNA-Met  90.91 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1097  tRNA-Met  90.91 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0037  tRNA-Met  90.91 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0053  tRNA-Met  90.91 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307129  normal  0.0211178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0019  tRNA-Met  90.91 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0035  tRNA-Met  90.91 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.906537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0036  tRNA-Met  90.91 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.784357  normal  0.0160013 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5037  tRNA-Met  97.96 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.794581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  97.96 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5049  tRNA-Met  97.96 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t56  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  97.96 
 
 		 80 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  97.96 
 
 		 80 bp  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  97.96 
 
 		 80 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA63  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R19  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000168289  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0011  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0027  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0920329  hitchhiker  0.000285559 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0090  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419074  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0045  tRNA-Met  97.96 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00820009  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0070  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0071  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957172  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0089  tRNA-Met  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0058  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4566  tRNA-Met  97.96 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  0.0841904 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0023  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000339625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0224  tRNA-Met  97.96 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000093753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0081  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000214937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0057  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000630751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0025  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000322634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0131  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0070  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0060  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0082  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000739583  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0024  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000157655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  97.96 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0017  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0088  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  97.92 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0009  tRNA-Met  94.64 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0043  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>