More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_R0003 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_R0003  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00215026  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAMetVIMSS1309196  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.868171  hitchhiker  0.00000970855 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAMetVIMSS1309108  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0023  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22048  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAMetVIMSS1309167  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAMetVIMSS1309377  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00798098  hitchhiker  0.0000123944 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAMetVIMSS1309263  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105935 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0012  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0040  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03939  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0023  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205789  normal  0.0373381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0052  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0858392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.51 
 
 		 80 bp  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  93.51 
 
 		 80 bp  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  93.51 
 
 		 80 bp  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0027  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0686525  normal  0.260083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0022  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.0369046 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0026  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0368817  normal  0.25242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  93.51 
 
 		 79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  93.51 
 
 		 79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0068  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0069  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0014  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0035  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575749  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0023  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.247152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0016  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0676778  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0046  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.363544  normal  0.0435272 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0016  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69639  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0043  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna34  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775098  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0050  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.540362  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0023  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000339625  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0014  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0020  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000159989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0042  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238456  normal  0.634383 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0076  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0024  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000157655  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000365135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0077  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0075  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.928415 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0027  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0920329  hitchhiker  0.000285559 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0013  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0557998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0039  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0045  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00820009  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0034  tRNA-Met  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0131764 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0057  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000630751  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt019  tRNA-Met  92.21 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00289748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-4  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0046  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0082  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000739583  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0028  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1857  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2507  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0081  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000214937  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0040  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.321259 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0131  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0026  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0305546  normal  0.617665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0034  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0047  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.808514  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1510  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268798  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0052  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0772  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0060  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0044  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0058  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263555  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0068  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5465  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.239722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>