More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0455 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0455  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00135587  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2250  tRNA-Met  95.77 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2163  tRNA-Met  95.77 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.214808  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0031  tRNA-Met  93.15 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169979  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0045  tRNA-Met  93.15 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0045  tRNA-Met  93.15 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0034  tRNA-Met  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0049  tRNA-Met  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256943  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0051  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0018  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1453  tRNA-Met  98 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0017  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.655239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0036  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106815  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-1  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-2  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0053  tRNA-Met  96.23 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307129  normal  0.0211178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0036  tRNA-Met  96.23 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.784357  normal  0.0160013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0035  tRNA-Met  96.23 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.906537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0048  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.726502  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0019  tRNA-Met  96.23 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0036  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0048  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t56  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA63  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet01  tRNA-Met  93.33 
 
 		 80 bp  87.7  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0096  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5465  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.239722  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0005  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.098649 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2751  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.74519e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0094  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0108  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137063  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t71  tRNA-Met  97.87 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0872657  hitchhiker  0.00727048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t029  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t030  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0002  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0004  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000171027  normal  0.958978 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0017  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0089  tRNA-Met  93.22 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014219  hitchhiker  0.00718403 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0002  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0633  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.811273  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60370  tRNA-Met  97.87 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60270  tRNA-Met  97.87 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0098  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.514232  decreased coverage  0.00128262 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0078  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0079  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0107  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0531774  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0078  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0634809  normal  0.33041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0079  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.060888  normal  0.335766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0090  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52320  tRNA-Met  97.87 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62790  tRNA-Met  97.87 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4588  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0074  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0075  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0076  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.195191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0009  tRNA-Met  94.55 
 
 		 72 bp  85.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0080  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654019  normal  0.0862038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0083  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208848  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0100  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.925668  decreased coverage  0.00140231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0099  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.69188  decreased coverage  0.00129939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0082  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0195288  normal  0.0518693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0091  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0032  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0102  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.872773  hitchhiker  0.00341362 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0112  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0110  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0138501  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0038  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0258342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0093  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0092  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0101  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.893911  decreased coverage  0.00145589 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2749  tRNA-Met  97.87 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000330212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0011  tRNA-Met  97.83 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089204  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0067  tRNA-Met  97.83 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00450958  hitchhiker  0.000893697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0065  tRNA-Met  97.83 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0014321  hitchhiker  0.000837814 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0025  tRNA-Met  97.83 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0064  tRNA-Met  97.83 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0037637  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0037  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0171  tRNA-Met  97.83 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0063  tRNA-Met  97.83 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00314729  hitchhiker  0.000241423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0062  tRNA-Met  97.83 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124144  hitchhiker  0.000239512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0061  tRNA-Met  97.83 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.000243294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0018  tRNA-Met  97.78 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00237238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0035  tRNA-Met  97.78 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0039  tRNA-Met  97.78 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.788311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0087  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00788985  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-1  tRNA-Met  94.64 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0023  tRNA-Met  94.23 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.3726300000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0606  tRNA-Met  94.64 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1100  tRNA-Met  94.64 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000893651  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0027  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0920329  hitchhiker  0.000285559 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1722  tRNA-Met  94.64 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0089  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0276092  hitchhiker  0.00000375071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0041  tRNA-Met  94.23 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0089  tRNA-Met  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0026  tRNA-Met  96.08 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000815309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0045  tRNA-Met  95.74 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0034  tRNA-Met  96.08 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>