17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0008 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0019  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 84 bp  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0024  tRNA-Ser  89.29 
 
 		 84 bp  95.6  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.1252  hitchhiker  0.00000142031 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0020  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 84 bp  87.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.255159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0026  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141177  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0002  tRNA-Ser  87.06 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.302196  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0068  tRNA-Ser  87.06 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.802658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0047  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.363749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0026  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0150471  normal  0.143163 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0047  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0012  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0026  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0053  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0017  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 101 bp  50.1  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.204935 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000880716  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.208848  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1221  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.164315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>