17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_R0026 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0068  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.802658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0053  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0024  tRNA-Ser  100 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.1252  hitchhiker  0.00000142031 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.302196  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0176232  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0069  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.980326  normal  0.628883 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0003  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.503711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0008  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0001  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0040  tRNA-Ser  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.412277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0047  tRNA-Ser  84.71 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0020  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.255159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00371061 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0041  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0012  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0016  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.505257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>