17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_R0047 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_R0047  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0012  tRNA-Ser  97.65 
 
 		 85 bp  153  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0016  tRNA-Ser  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.505257 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0041  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0001  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0238116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0026  tRNA-Ser  84.71 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0019  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1221  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.164315  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0068  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.802658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0053  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.208848  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0026  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141177  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0002  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.302196  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0024  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.1252  hitchhiker  0.00000142031 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000880716  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0017  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 101 bp  44.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.204935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>