12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_R0019 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_R0019  tRNA-Ser  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0020  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 84 bp  143  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.255159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0008  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 87 bp  111  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0026  tRNA-Ser  91.03 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141177  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0024  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 84 bp  87.7  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.1252  hitchhiker  0.00000142031 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0002  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.302196  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0047  tRNA-Ser  89.33 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.363749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0068  tRNA-Ser  88.31 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.802658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0026  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0150471  normal  0.143163 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0047  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0012  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00194399  normal  0.157065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>