14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0026 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141177  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0047  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 85 bp  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.363749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0068  tRNA-Ser  95.71 
 
 		 85 bp  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.802658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0002  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 85 bp  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.302196  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0026  tRNA-Ser  92 
 
 		 85 bp  101  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0150471  normal  0.143163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0019  tRNA-Ser  91.03 
 
 		 84 bp  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0024  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 84 bp  83.8  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.1252  hitchhiker  0.00000142031 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0008  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0020  tRNA-Ser  90 
 
 		 84 bp  75.8  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.255159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0053  tRNA-Ser  88.57 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0017  tRNA-Ser  100 
 
 		 101 bp  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.204935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0047  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0012  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0095  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.971553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>