6 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_R0017 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_R0017  tRNA-Ser  100 
 
 		 101 bp  200  5e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.204935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  52  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141177  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0008  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0095  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.971553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0047  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0012  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>