10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_R0026 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0150471  normal  0.143163 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0047  tRNA-Ser  90.59 
 
 
85 bp  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.363749  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0026  tRNA-Ser  92 
 
 
85 bp  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141177  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0068  tRNA-Ser  90.67 
 
 
85 bp  93.7  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.802658  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0002  tRNA-Ser  89.33 
 
 
85 bp  85.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.302196  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0008  tRNA-Ser  95.12 
 
 
87 bp  65.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0024  tRNA-Ser  91.84 
 
 
84 bp  65.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.1252  hitchhiker  0.00000142031 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0019  tRNA-Ser  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0020  tRNA-Ser  89.8 
 
 
84 bp  58  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.255159  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0053  tRNA-Ser  82.67 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.35956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>