9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_R0001 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0238116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0016  tRNA-Ser  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.505257 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0041  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0047  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0047  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.363749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0012  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.814887  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0075  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>