26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4326 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_4326  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0121967  normal  0.525064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0013  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0899953 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1876  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0009  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.763492  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0014  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0044  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872486  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0034  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498684  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0009  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0014  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000108759  hitchhiker  0.00000048604 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03620  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0256458  normal  0.0430862 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02220  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0045  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0092775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0023  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0004  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.549944  normal  0.0458093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0041  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0013  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356176  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0020  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243975  normal  0.0115468 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t39  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_712  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0740718  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00568015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>