34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_R0023 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53531  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0030  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.931427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0014  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309210  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309130  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0027  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.654797  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0051  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 82 bp  54  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000403882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0015  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984561 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309296  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17211  acetylornithine aminotransferase  84.51 
 
 		 1263 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14621  acetylornithine aminotransferase  84.51 
 
 		 1254 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309380  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0032  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309098  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309171  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.622371  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1397  acetylornithine aminotransferase  93.55 
 
 		 1254 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt010  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13491  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  93.55 
 
 		 1263 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14871  acetylornithine aminotransferase  93.55 
 
 		 1254 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.387015  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309259  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0082  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212211  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  86 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0029  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0582952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>