75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_R0030 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.931427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0051  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000403882  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0032  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309098  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309130  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309210  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309171  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.622371  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0023  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53531  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0014  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309380  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  90.16 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14871  acetylornithine aminotransferase  96.88 
 
 		 1254 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.387015  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13491  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  96.88 
 
 		 1263 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17211  acetylornithine aminotransferase  96.88 
 
 		 1263 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14621  acetylornithine aminotransferase  96.88 
 
 		 1254 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0015  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984561 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1397  acetylornithine aminotransferase  96.88 
 
 		 1254 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0049  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  88.52 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14940  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.183557  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0037  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0023  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0188158  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0021  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0039  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304437  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0075  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0037  tRNA-Leu  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000169907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0054  tRNA-Leu  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0764192  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0008  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.429157  normal  0.0709893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0013  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.111506  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309296  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0013  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6027  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0853509  normal  0.33546 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0003  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.27251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0071  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.690951  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3148t  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.654797  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0004  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3153t  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000997462  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3150t  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000767874  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3146t  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000598983  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3144t  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000564151  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>