115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_R0082 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_R0082  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212211  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0091  tRNA-Leu  97.65 
 
 		 85 bp  153  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352148  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0002  tRNA-Leu  97.1 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0014  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.472539  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0015  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0016  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.465569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu04  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.56181 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0731155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0088  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0049  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0092  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0052  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0614  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114881  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5720  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0539  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.1762e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4763  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000114047  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0029  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0582952  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0050  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.822506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0055  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.472403  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0002  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_BR0021  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.365312  normal  0.141763 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0042  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0052  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1164  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0079  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0072  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0069  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390997  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0041  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2934  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1003  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1010  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1665  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0028  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0046  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470229  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0072  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0039  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    84.38 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4321  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0032  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  84.38 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0007  tRNA-Leu  84.38 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0058  tRNA-Leu  84.38 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0031  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.926824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA50  tRNA-Leu  84.38 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.391222  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0039  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20505  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0002  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.180392  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t19  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39518  normal  0.0378684 
 
 
-
 
NC_002950  PGt14  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.211002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t19  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.207136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA20  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R73  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0020  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000105173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0032  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000644155  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0027  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130394  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0053  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0023  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0030  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.624579  normal  0.3525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0034  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159926  normal  0.424933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0069  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000612971 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0009  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53531  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t25  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0067  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  84.48 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0032  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0173175  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309259  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0039  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6606  ceramide glucosyltransferase  100 
 
 		 1209 bp  44.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00329777  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365522  normal  0.0296897 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0027  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.661326  normal  0.191981 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>