57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_R0091 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_R0091  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0082  tRNA-Leu  97.65 
 
 		 85 bp  153  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212211  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0016  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.465569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0015  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0014  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.472539  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0002  tRNA-Leu  94.2 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu04  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617497 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0002  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0009  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0058  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0007  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_BR0021  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.365312  normal  0.141763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA50  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.391222  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0067  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0039  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.56181 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5720  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0092  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257309  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0614  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0088  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4763  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000114047  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0539  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.1762e-32 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0049  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0052  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0032  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0731155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0010  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000185215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0070  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0042  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0050  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.822506 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0029  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0582952  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0052  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0055  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.472403  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0019  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0055  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0041  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238248  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0036  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>