16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_BR0021 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_BR0021  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.365312  normal  0.141763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0002  tRNA-Leu  85.07 
 
 
85 bp  54  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379768  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0082  tRNA-Leu  85.07 
 
 
85 bp  54  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212211  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0091  tRNA-Leu  85.07 
 
 
85 bp  54  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352148  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  84.62 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0002  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0006  tRNA-Leu  96.3 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.399437  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0005  tRNA-Leu  96.3 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.916543 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0006  tRNA-Leu  96.3 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0006  tRNA-Leu  96.3 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.785646  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0014  tRNA-Leu  89.47 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0002  tRNA-Leu  82.05 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.180392  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0008  tRNA-Leu  89.47 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0040  tRNA-Leu  96.15 
 
 
80 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.850401 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0070  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0077  tRNA-Leu  96.15 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.899895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>