51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_R0032 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  84.88 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0055  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.472403  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0031  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264457  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0050  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.840462  normal  0.934802 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0031  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0696891  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0019  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0058  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0007  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    92.86 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0009  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA50  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.391222  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  90 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0572  tRNA-Leu  90 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0091  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0082  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212211  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu04  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617497 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0024  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.154328 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4742  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5788  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0370957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4872  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0248766 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4772  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.193191  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5112  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00828021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0614  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114881  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5720  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4763  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000114047  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0539  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.1762e-32 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0075  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0082  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0052  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0014  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0088  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0082  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0731155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0015  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4891  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.762047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4726  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0202862  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00083  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0092  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0097  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.138568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4752  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4955  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.2776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4835  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.80579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>