291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_R0049 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0088  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0731155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0092  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257309  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5720  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0614  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0539  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.1762e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4763  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000114047  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0052  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu04  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0082  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212211  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0042  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535149 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0039  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20505  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0052  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0050  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.822506 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31720  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0173175  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4332  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0836194  normal  0.282288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0007  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0058  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000273568  normal  0.583061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477099  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA50  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.391222  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  100 
 
 		 1389 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309067  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.086825  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0009  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309118  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.253847  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0010  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000185215  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309143  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1215  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000105173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0091  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352148  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0027  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130394  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0750  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0310097  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507669  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0055  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.472403  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309345  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.419344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419334  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4578  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0002  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t19  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t20  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4338  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4568  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.666254  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0000161496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0017  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.344367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.899585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299812  normal  0.066505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0015  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1044  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6043  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.843688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0110996  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.477957  normal  0.0356548 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129877  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.566958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0404485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247967  decreased coverage  0.00943738 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0645  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.282647  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0016  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.465569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0014  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.472539  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0013  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>