48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_R0036 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238248  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0044  tRNA-Leu  98.8 
 
 		 85 bp  157  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000717769  normal  0.735401 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0027  tRNA-Leu  97.59 
 
 		 85 bp  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.661326  normal  0.191981 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0035  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 82 bp  131  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000299197  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t25  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0029  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0125936  normal  0.289894 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0017  tRNA-Leu  95 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000127557  hitchhiker  0.00355692 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0021  tRNA-Leu  95 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000206459  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0016  tRNA-Leu  95 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115264  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t14  tRNA-Leu  95 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0022  tRNA-Leu  95 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.0213265 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0010  tRNA-Leu  95 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000723961  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0054  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0064  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0065  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0027  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0059  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0017  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0024  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0037  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17135  normal  0.776036 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0025  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0026  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0021  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0064  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169248 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0042  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.574656  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0033  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0594182 
 
 
-
 
NC_003295  RS02877  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000533754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03726  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0825956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0072  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0073  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0037  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583149  normal  0.146154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0038  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360445  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0024  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0034  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0585247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0013  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0050  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0076  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737133  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0077  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.941886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0078  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.914588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0079  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.966299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt51  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0048  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.547841 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0036  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0091  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352148  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.570293  normal  0.011385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>