73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_t25 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_t25  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0035  tRNA-Leu  98.78 
 
 		 82 bp  155  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000299197  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0027  tRNA-Leu  96.39 
 
 		 85 bp  141  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.661326  normal  0.191981 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0044  tRNA-Leu  95.18 
 
 		 85 bp  133  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000717769  normal  0.735401 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0041  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238248  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0036  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0019  tRNA-Leu  93.98 
 
 		 85 bp  125  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0054  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0064  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0029  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0125936  normal  0.289894 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0065  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0027  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01236  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6027  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0853509  normal  0.33546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0076  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737133  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0037  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17135  normal  0.776036 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0050  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572114 
 
 
-
 
NC_002950  PGt51  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0013  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0077  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.941886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0078  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.914588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0079  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.966299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0024  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0048  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.547841 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0024  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0059  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0017  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0021  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000206459  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0022  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.0213265 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0017  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000127557  hitchhiker  0.00355692 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0016  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115264  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0033  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0594182 
 
 
-
 
NC_003295  RS02877  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000533754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03726  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0825956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0072  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0073  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0042  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.574656  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t14  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0064  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0023  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0188158  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0021  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0026  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0025  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0010  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000723961  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0037  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583149  normal  0.146154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0038  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360445  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0034  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0585247 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.230012  normal  0.790911 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt14  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.211002 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000564776  hitchhiker  0.00000000298253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0082  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212211  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344693  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0991  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0023  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 80 bp  44.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0073  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.23668 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0086  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0082  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00186312  normal  0.0281447 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0032  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000644155  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0020  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000105173  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.977915  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211944 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0075  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000964905  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt10  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>