29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_R0011 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.664926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19630  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 84 bp  81.8  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93343  normal  0.0188921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0048  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t58  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334218  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0072  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828257  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0051  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.815889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  86.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  83.95 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0002  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1381  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0029  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49401  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0004  tRNA-Leu  84.93 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  84.72 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0002  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.180392  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0093  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0876  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.322681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0032  tRNA-Leu  84.29 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0064  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0049  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.319274  normal  0.459063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>