15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_R0049 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_R0049  tRNA-Gly  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.319274  normal  0.459063 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0876  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.322681  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0119    96.43 
 
 		 355 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0119    96.43 
 
 		 355 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0050    96.43 
 
 		 356 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.255833  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0116    96.43 
 
 		 355 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.798208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0032    96.43 
 
 		 356 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.118397 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0037    96.3 
 
 		 355 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0004  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0044    96.3 
 
 		 355 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0020    96.3 
 
 		 355 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0668776 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1015  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0038  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.504374  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0011  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.664926  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>