83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_R0017 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.665018  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0004  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1577  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1612  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0022  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.35191  normal  0.518198 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0006  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.399437  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0006  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0051  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0006  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.785646  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0005  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.916543 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0071  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.914369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA50  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.391222  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0002  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0009  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6024  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658515  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0016  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000907276  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0037  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248476 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4578  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0058  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0007  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0081  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0027  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130394  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0039  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304437  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0014  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000108759  hitchhiker  0.00000048604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0045  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  normal  0.134818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0038  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11040  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.12642  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0038  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0070  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0034  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245269  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0047  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.1151  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0040  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt51  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0012  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02662  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0048  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.570293  normal  0.011385 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000356582  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00150158  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0057  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0047  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.232524  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu04  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617497 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0031  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0836194  normal  0.282288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0012  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>