30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_R0047 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_R0047  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.232524  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0059  tRNA-Ser  91.36 
 
 		 88 bp  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00150158  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0011  tRNA-Ser  90 
 
 		 89 bp  99.6  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0011  tRNA-Ser  90 
 
 		 89 bp  99.6  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000356582  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0021  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  91.7  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.443541  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0002  tRNA-Ser  87.91 
 
 		 89 bp  79.8  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0001521  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0002  tRNA-Ser  87.91 
 
 		 89 bp  79.8  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000210278  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0012  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0008  tRNA-Ser  87.84 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0562701  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0051  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0039  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000913724  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6024  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658515  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0018  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00379484  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0031  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0049  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000532308  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0018  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446903  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00310588  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0001  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0066  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0635927  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>