25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0008 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0059  tRNA-Ser  92.21 
 
 
88 bp  89.7  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00150158  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0012  tRNA-Ser  88 
 
 
86 bp  77.8  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0047  tRNA-Ser  87.84 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.232524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0011  tRNA-Ser  96.97 
 
 
89 bp  58  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000356582  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0021  tRNA-Ser  86.3 
 
 
88 bp  58  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.443541  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0011  tRNA-Ser  96.97 
 
 
89 bp  58  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0026  tRNA-Ser  84.72 
 
 
86 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0562701  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0002  tRNA-Ser  96.55 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000210278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  96.55 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0002  tRNA-Ser  96.55 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0001521  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230626  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6024  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658515  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0050  tRNA-Thr  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0595881  unclonable  6.505860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0051  tRNA-Ser  93.33 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>