128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_R0026 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.794805  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0001  tRNA-Leu  95.4 
 
 		 87 bp  133  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0005  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  0.341408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0006  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301986  normal  0.331318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0097  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0752348  normal  0.27021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0098  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0692613  normal  0.384897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0099  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000201968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0100  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0081  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.491812  normal  0.178181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t73  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t74  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0005  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000679583  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0002  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217421  hitchhiker  0.000407536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0003  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.14318  hitchhiker  0.000405393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0013  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0003    87.36 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4332  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0011  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0045  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0015  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0034  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0082  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367959  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0006  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0001  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0037  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0003  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.426461  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0066  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477099  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0033  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0012  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.145187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0007  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0003  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1053  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0003  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R11  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0004  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.549944  normal  0.0458093 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0041  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5665  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5666  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0072  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0068  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0006  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.26401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0071  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193194  normal  0.106914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t58  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.544778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t59  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.523446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA2  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA3  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0003  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1054  hypothetical protein  87.5 
 
 		 114 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169322  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0019  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0002  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.164011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1365  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65210  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65220  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA2  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.839683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0035  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309345  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.419344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60600  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60590  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0002  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R10  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.919208  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R36  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0004  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.889028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0023  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00937245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0077  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0025  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0680936  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  83.13 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0002  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0063  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0200123  decreased coverage  0.00662363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0033  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0065  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0012  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.594813  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03726  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0825956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2521  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000206835  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0032  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000233164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0028  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0191582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0041  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00498551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0042  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00146649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0043  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00579317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0037  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583149  normal  0.146154 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0034  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0585247 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1753  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0013  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0050  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572114 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0142  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0162702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1796  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0107643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1814  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0041  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  0.0670034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0042  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00515288  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0043  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0955991  normal  0.0560674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0043  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00336489  normal  0.0463602 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0044  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00713145  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0073  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357526  normal  0.875145 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0044  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0045  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0249109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0058  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.031722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0059  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418703 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>