37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_R0073 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_R0073  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357526  normal  0.875145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0003  tRNA-Leu  97.59 
 
 		 83 bp  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0063  tRNA-Leu  97.59 
 
 		 86 bp  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0003  tRNA-Leu  95.18 
 
 		 83 bp  133  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00430  tRNA-Leu  91.57 
 
 		 83 bp  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366056  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0003  tRNA-Leu  91.57 
 
 		 86 bp  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48253  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0003  tRNA-Leu  90.36 
 
 		 86 bp  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0003  tRNA-Leu  89.16 
 
 		 86 bp  93.7  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207592  hitchhiker  0.00400711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0055  tRNA-Leu  91.55 
 
 		 86 bp  93.7  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0003  tRNA-Leu  93.44 
 
 		 84 bp  89.7  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0003  tRNA-Leu  89.61 
 
 		 83 bp  89.7  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0003  tRNA-Leu  89.61 
 
 		 83 bp  89.7  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0069  tRNA-Leu  87.95 
 
 		 83 bp  85.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.649401 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0003  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0003  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0003  tRNA-Leu  90.16 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257366  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0003  tRNA-Leu  90.16 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0003  tRNA-Leu  90.16 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0002  tRNA-Leu  90.16 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0003  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.068778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00250  tRNA-Leu  88.52 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0003  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 83 bp  60  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190656 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0031  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0836194  normal  0.282288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0020  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000105173  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0038  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0003  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 83 bp  60  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0003  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 83 bp  60  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4332  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31720  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  84.38 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000345665  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0026  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.794805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>