79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_R0038 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_R0038  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0033  tRNA-Asn  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0048  tRNA-Asn  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0027  tRNA-Asn  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13840  tRNA-Asn  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305129  normal  0.453379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0032  tRNA-Asn  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.275296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0029  tRNA-Asn  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0033  tRNA-Asn  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179763  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0029  tRNA-Asn  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0716231  normal  0.649346 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0032  tRNA-Asn  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0037  tRNA-Asn  93.15 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0025  tRNA-Asn  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000914395 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0027  tRNA-Asn  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0793414  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0026  tRNA-Asn  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117837  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0025  tRNA-Asn  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0019  tRNA-Asn  92.06 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14020  tRNA-Asn  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11930  tRNA-Asn  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0127142  normal  0.206625 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0042  tRNA-Asn  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06350  tRNA-Asn  90.41 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0031  tRNA-Asn  89.86 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167609  hitchhiker  0.00292997 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0033  tRNA-Asn  94.23 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000143067  hitchhiker  0.0000025916 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0048  tRNA-Asn  89.04 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0752552 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0030  tRNA-Asn  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0049  tRNA-Asn  89.04 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0762286 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0004  tRNA-Asn  88.71 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.392598  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14025  tRNA-Asn  88.71 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0078  tRNA-Asn  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1392  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0040  tRNA-Asn  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA44  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366326  normal  0.398045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0017  tRNA-Asn  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0056  tRNA-Asn  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167175  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0029  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0042  tRNA-Asn  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699754 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0013  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00468588  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0005  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.657067  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0003  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.401979  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.360005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177541  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0118555  normal  0.877407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0053  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000300165  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t39  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107973  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t43  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.546364  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000000806008  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0026  tRNA-Asn  89.13 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000338371  normal  0.10818 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0021  tRNA-OTHER  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0370611 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0024  tRNA-Asn  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0017  tRNA-Asn  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.808131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0018  tRNA-Asn  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0018  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.340441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0048  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000334788 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07580  tRNA-Asn  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.16811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0043  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0050  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016026  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4590  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0042  tRNA-Asn  83.87 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0276832  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0295  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0025  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0132598  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0174  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0415  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0379576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0053  tRNA-Asn  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.32132  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0006  tRNA-Asn  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.242548  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0020  tRNA-Asn  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0063  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0086  tRNA-Asn  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000469656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0090  tRNA-Asn  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16810  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0598993  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0033  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0020  tRNA-Asn  83.87 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0020  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0020  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>