15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_R0024 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_R0024  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000359356  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0061  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0071  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0030  tRNA-His  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0021  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000904393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0021  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0059  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0015  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0033  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.773389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0052  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00451964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0011  tRNA-Trp  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.998721  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0030  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0014  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0013  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0015  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00550312  hitchhiker  0.000000644628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>