67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_R0043 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_R0043  tRNA-Asn  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0047  tRNA-Asn  97.22 
 
 		 75 bp  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000000251185  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t43  tRNA-Asn  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.546364  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0008  tRNA-Asn  97.22 
 
 		 75 bp  127  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0851483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0013  tRNA-Asn  95.38 
 
 		 72 bp  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00468588  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0013  tRNA-Asn  93.06 
 
 		 75 bp  103  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0070  tRNA-Asn  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.213378  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0054  tRNA-Asn  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0018  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0017  tRNA-Asn  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000360028  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0010  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00716617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0027  tRNA-Asn  92.73 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0033  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000143067  hitchhiker  0.0000025916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0011  tRNA-Asn  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00974618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0016  tRNA-Asn  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000166672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0056  tRNA-Asn  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0027  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0027  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0226012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0075  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000782806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0011  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36604 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0075  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0888868  normal  0.929022 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0013  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00234115  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06350  tRNA-Asn  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07580  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.16811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0023  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0800816  normal  0.0382047 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0018  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0030  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.28172  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0056  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0031  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167609  hitchhiker  0.00292997 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0013  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.882004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0052  tRNA-Asn  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.292372  normal  0.128808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0075  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_714  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0692708  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0076  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0037  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0078  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.184642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0076  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0067  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.143044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0056  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.880886  decreased coverage  0.00985409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0031  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0885898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0073  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0022  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.275054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0084  tRNA-Asn  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000101082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0033  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0039  tRNA-Asn  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268211  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0027  tRNA-Asn  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0063  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0057  tRNA-Asn  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000258126  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0025  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0042  tRNA-Asn  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0053  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0045  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0038  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0019  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0047  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0072652  decreased coverage  0.00838785 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0025  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000914395 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0026  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0027  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0793414  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0030  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11930  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0127142  normal  0.206625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0047  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.787632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0007  tRNA-Asn  84.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0034  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0014  tRNA-Asn  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355539  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0034  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0206765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>