49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_06350 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_06350  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0037  tRNA-Asn  95.16 
 
 
72 bp  99.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07580  tRNA-Asn  92.54 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.16811  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0030  tRNA-Asn  91.78 
 
 
73 bp  89.7  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0027  tRNA-Asn  90.54 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0019  tRNA-Asn  90.41 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615081  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0038  tRNA-Asn  90.41 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11930  tRNA-Asn  90.41 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0127142  normal  0.206625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0031  tRNA-Asn  91.3 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167609  hitchhiker  0.00292997 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16810  tRNA-Asn  92.86 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0598993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0023  tRNA-Asn  89.55 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0800816  normal  0.0382047 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0033  tRNA-Asn  89.55 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000143067  hitchhiker  0.0000025916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0029  tRNA-Asn  89.55 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA44  tRNA-Asn  89.55 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366326  normal  0.398045 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0049  tRNA-Asn  90.32 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0762286 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0048  tRNA-Asn  90.32 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0752552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13840  tRNA-Asn  89.19 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305129  normal  0.453379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0033  tRNA-Asn  89.19 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179763  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0029  tRNA-Asn  89.04 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0029  tRNA-Asn  89.04 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0716231  normal  0.649346 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0032  tRNA-Asn  89.04 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0027  tRNA-Asn  87.67 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0226012  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0033  tRNA-Asn  90.48 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0027  tRNA-Asn  97.44 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0793414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0025  tRNA-Asn  97.44 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000914395 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0026  tRNA-Asn  97.44 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117837  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0013  tRNA-Asn  90.74 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0025  tRNA-Asn  93.48 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0048  tRNA-Asn  88.89 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    89.09 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  88.89 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0043  tRNA-Asn  90 
 
 
72 bp  60  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0032  tRNA-Asn  86.49 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.275296  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0020  tRNA-Asn  87.27 
 
 
75 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0020  tRNA-Asn  87.27 
 
 
75 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4590  tRNA-Asn  87.27 
 
 
75 bp  54  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0013  tRNA-Asn  88.24 
 
 
72 bp  54  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00468588  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0014  tRNA-Asn  88.24 
 
 
75 bp  54  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355539  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0009  tRNA-Lys  90.48 
 
 
73 bp  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000488659  normal  0.0708326 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t43  tRNA-Asn  88 
 
 
72 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.546364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0021  tRNA-Asn  90 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.552016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0069  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.092097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0043  tRNA-Asn  83.58 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0023  tRNA-Lys  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0024  tRNA-Asn  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1392  tRNA-Asn  89.74 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0028  tRNA-Asn  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246384  normal  0.65431 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0036  tRNA-Met  100 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582782  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0041  tRNA-Asn  85.19 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>