48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_R0049 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_R0048  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0752552 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0049  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0762286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0042  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0037  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14020  tRNA-Asn  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06350  tRNA-Asn  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0048  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0038  tRNA-Asn  89.04 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0004  tRNA-Asn  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.392598  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0078  tRNA-Asn  89.55 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16810  tRNA-Asn  88.71 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0598993  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0031  tRNA-Asn  93.48 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167609  hitchhiker  0.00292997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0018  tRNA-Asn  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0017  tRNA-Asn  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.808131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0033  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0014  tRNA-Asn  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355539  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0056  tRNA-Asn  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167175  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0021  tRNA-Asn  94.87 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.552016 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0023  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0800816  normal  0.0382047 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0005  tRNA-Asn  94.87 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.657067  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0003  tRNA-Asn  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.401979  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0027  tRNA-Asn  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0017  tRNA-Asn  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA44  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366326  normal  0.398045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0029  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0015  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00550312  hitchhiker  0.000000644628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0025  tRNA-Asn  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0027  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0226012  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0025  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.452257 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0018  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0033  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000143067  hitchhiker  0.0000025916 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0020  tRNA-Asn  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0025  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000914395 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07580  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.16811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0013  tRNA-Asn  86.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00468588  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0027  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0793414  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0026  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117837  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0026  tRNA-Asn  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000338371  normal  0.10818 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0024  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0020  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4590  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0020  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0021  tRNA-OTHER  92.11 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0370611 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t43  tRNA-Asn  86 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.546364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>