47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_R0037 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_R0037  tRNA-Asn  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0033  tRNA-Asn  95.89 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0048  tRNA-Asn  94.52 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06350  tRNA-Asn  95.16 
 
 		 75 bp  99.6  8e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0038  tRNA-Asn  93.15 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0049  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0762286 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0048  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0752552 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16810  tRNA-Asn  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0598993  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0029  tRNA-Asn  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA44  tRNA-Asn  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366326  normal  0.398045 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0033  tRNA-Asn  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000143067  hitchhiker  0.0000025916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0027  tRNA-Asn  97.44 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0793414  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0026  tRNA-Asn  97.44 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117837  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0025  tRNA-Asn  97.44 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000914395 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07580  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.16811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0027  tRNA-Asn  87.67 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0029  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0716231  normal  0.649346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13840  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305129  normal  0.453379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0032  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.275296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0029  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0033  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179763  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0032  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0025  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0026  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000338371  normal  0.10818 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0015  tRNA-Asn  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00550312  hitchhiker  0.000000644628 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t43  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.546364  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0013  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4590  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0019  tRNA-Asn  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0023  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0800816  normal  0.0382047 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0013  tRNA-Asn  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00468588  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0020  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0020  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0078  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0043  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0030  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14020  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0042  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0004  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.392598  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1392  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11930  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0127142  normal  0.206625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0024  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0031  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167609  hitchhiker  0.00292997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0027  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0226012  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0028  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246384  normal  0.65431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>