188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP_tRNA-Asn-3 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5015  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0225437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5647  tRNA-Asx  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5656  tRNA-Asx  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5705  tRNA-Asx  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5713  tRNA-Asx  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.423008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5800  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00845439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4984  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 78 bp  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 78 bp  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0717839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 78 bp  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0120777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 78 bp  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000216624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 78 bp  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 78 bp  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 78 bp  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 78 bp  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00125687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 78 bp  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000687099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 78 bp  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000262097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 78 bp  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.449639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 78 bp  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0033  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000091972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0111  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00999623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0074  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0167  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641958 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000965695  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5663  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000092576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0796  tRNA-Glu  98.67 
 
 		 153 bp  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.41258e-33 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0124  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5743  tRNA-Glu  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000765198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0120  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0042  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000134576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0231  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4560  tRNA-Glu  98.67 
 
 		 153 bp  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000215336  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5053  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000166826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0291  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0188  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0115  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0269  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5650  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 77 bp  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0871  tRNA-Glu  98.67 
 
 		 153 bp  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0042  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000233042  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5706  tRNA-Asn  97.33 
 
 		 77 bp  133  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000905345  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  98.59 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5671  tRNA-Asx  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  97.33 
 
 		 78 bp  133  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  97.33 
 
 		 78 bp  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.043106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  97.33 
 
 		 78 bp  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5148  tRNA-Asn  97.33 
 
 		 77 bp  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  normal  0.479478 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000655937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0524  tRNA-Asn  97.33 
 
 		 77 bp  133  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4385300000000005e-28 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0033  tRNA-Asn  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.104706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4777  tRNA-Asn  97.33 
 
 		 77 bp  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000213851  hitchhiker  0.0000000000000219436 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0077  tRNA-Asn  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000930167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0600  tRNA-Asn  97.33 
 
 		 77 bp  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000379275  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0078  tRNA-Asn  97.18 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0031  tRNA-Asn  97.18 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000435649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0026  tRNA-Asn  97.18 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000025046  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0031  tRNA-Asn  97.18 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000375909  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0078  tRNA-Asn  97.18 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0027  tRNA-Asn  97.18 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000161448  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0038  tRNA-Asn  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0117  tRNA-Asn  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0032  tRNA-Asn  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0015  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0005  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.570068 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0014  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0090  tRNA-Asn  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0029  tRNA-Asn  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0054  tRNA-Asn  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0042  tRNA-Asn  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0083  tRNA-Asn  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233313  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0025  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.691429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0043  tRNA-Asn  94.55 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  90 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00645597  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0500  tRNA-Asn  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00327724  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1748  tRNA-Asn  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0030  tRNA-Asn  92.73 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0041  tRNA-Asn  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000401156  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0036  tRNA-Asn  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAsnVIMSS1309370  tRNA-Asn  92.73 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAsnVIMSS1309217  tRNA-Asn  92.73 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_714  tRNA-Asn  88.57 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0692708  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0022  tRNA-Asn  88.57 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.275054  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0531  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0008  tRNA-Asn  91.07 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0013  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0044  tRNA-Asn  91.07 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0403004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0039  tRNA-Asn  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092174  hitchhiker  0.00180785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0029  tRNA-Asn  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0127801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0056  tRNA-Asn  91.38 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0045  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000031214  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0023  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000728017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0024  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000367183  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0025  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000379634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>