More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflt06 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mflt011  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0172063  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt06  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000258702  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0407  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.440416  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0829  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00351824  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.205376  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0599  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R28  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0073  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0022  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0009  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.538917  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0021  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0160361  normal  0.0210498 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0016  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000293232  hitchhiker  0.00358578 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0009  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161944  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0037  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0220661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0013  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000751402  hitchhiker  0.00049281 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1446  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00029205  normal  0.742429 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt04  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t005  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0042  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000882152  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t080  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t082  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4589  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0094  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00138001  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0092  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000157949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0110  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000430973  normal  0.778481 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0024  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0086  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0209186  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0011  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0112  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000415626  normal  0.792835 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0026  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21552  normal  0.0153028 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0088  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0412207  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0046  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000000451939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0005  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000832804  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t007  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000938468  normal  0.123199 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2799  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000124978  normal  0.096994 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0133  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000500666  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0004  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000250718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0156  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000748575  hitchhiker  0.000108427 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t027  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00943249  normal  0.0402241 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t029  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00426722  normal  0.039681 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0021  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0103  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000642659  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0006  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000181943  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0033  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000977619  normal  0.440974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0029  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.781659  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0012  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000230734  normal  0.0248915 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0050  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0052  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000085939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0101  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000191032  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0012  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000866174  hitchhiker  0.00954127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0051  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0041266  normal  0.480692 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0053  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000457267  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4244  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000127626  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0062  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4289  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.11347e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0029  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132706  normal  0.393089 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0013  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0044  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550992  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0152  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000140276  hitchhiker  0.00000000136531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0009  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521026  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0010  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000391547  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0103  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000466787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0019  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00333528  normal  0.979216 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0113  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0423055  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0069  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.489026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0022  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00933326  normal  0.943049 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1581  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1616  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.620085 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0127  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000000904299  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0031  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000122273  normal  0.278033 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0012  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013609  normal  0.0833663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0049  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00847785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0051  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00673114  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t058  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t059  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t061  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t062  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0050  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000187157  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0031  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000370273  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0052  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421031  normal  0.358949 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0051  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000189133  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0053  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0054  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0107  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000698154  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0108  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000827722  normal  0.14321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0109  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000069936  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0110  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000341458  normal  0.142626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0111  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000430182  normal  0.144334 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0112  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000430182  normal  0.144334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0086  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000000910147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0031  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000137565  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0105  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121754  normal  0.0191559 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0106  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745947  normal  0.0185833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0107  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000134786  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0108  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000143364  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0109  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000013008  normal  0.0178475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0110  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000621633  normal  0.0176654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>