172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_R28 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_R28  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R85  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000392711  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0407  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.440416  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0829  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt011  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0172063  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt06  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000258702  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0049  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000433504  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0050  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000354715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0051  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000442391  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0040  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0275291  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t11  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000006616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t36  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.036377  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0026  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1988  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.977755  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60060  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.678993  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0046  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0028  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.505293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23490  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00227157  hitchhiker  0.00614087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60180  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000682049  hitchhiker  0.0000000115444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0075  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5180  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.851962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0004  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0027  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.75485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0021  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.503528  normal  0.129544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0076  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0515739  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0086  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000469656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0090  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0046  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000070452  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0044  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000104273  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0134  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000272379  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t055  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t057  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t058  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t059  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t061  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t062  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0130  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000587848  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0325  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.924352  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0043  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216676  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0049  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000179433  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0050  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000934403  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0051  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000803834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0052  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072516  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0053  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0054  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651071  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4531  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0107  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000698154  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0108  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000827722  normal  0.14321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0109  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000069936  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0110  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000341458  normal  0.142626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0111  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000430182  normal  0.144334 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0112  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000430182  normal  0.144334 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0113  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000430182  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0107  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00061714  normal  0.366999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0108  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.368852 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0109  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000145947  normal  0.372291 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0110  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000275049  normal  0.380148 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0111  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000310231  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0112  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  normal  0.38206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0113  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000217944  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51660  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.69309e-16  hitchhiker  0.000488803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60150  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526914  hitchhiker  0.0000000110611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5178  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.847952  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0104  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000434862  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0105  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121754  normal  0.0191559 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0106  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745947  normal  0.0185833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0107  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000134786  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0108  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000143364  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0109  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000013008  normal  0.0178475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0110  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000621633  normal  0.0176654 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0079  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000144555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0080  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000136157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0081  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000158671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0086  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000000910147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0031  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000370273  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0032  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000864577  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0034  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000104343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0035  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000579305  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0037  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000625887  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0038  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000589409  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0039  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000604757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0050  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000187157  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0051  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000189133  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0052  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421031  normal  0.358949 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0053  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000170712  normal  0.532775 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0054  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000247004  normal  0.542082 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0055  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000238115  normal  0.540083 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0056  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000234634  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0030  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000178627  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0031  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000137565  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0032  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000114848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0033  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000129521  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0034  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000147574  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0035  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000175048  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0048  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000292562  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0047  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000310964  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0045  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000121203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0133  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000140941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0132  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000635495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0131  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000583182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>