299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_R0049 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_R0049  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000433504  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0050  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000354715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0051  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000442391  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0040  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0275291  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0067  tRNA-Asn  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0043  tRNA-Asn  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.362716  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0078  tRNA-Asn  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.184642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0076  tRNA-Asn  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0073  tRNA-Asn  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0086  tRNA-Asn  93.06 
 
 
76 bp  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000469656  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0090  tRNA-Asn  93.06 
 
 
76 bp  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613104  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R85  tRNA-Asn  96.61 
 
 
76 bp  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000392711  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0046  tRNA-Asn  91.67 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0075  tRNA-Asn  91.67 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173249  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0024  tRNA-Asn  98.08 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360074  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5180  tRNA-Asn  91.67 
 
 
78 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.851962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0028  tRNA-Asn  91.67 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.505293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0026  tRNA-Asn  91.67 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248666  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0004  tRNA-Asn  91.67 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0027  tRNA-Asn  91.67 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.75485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1988  tRNA-Asn  91.67 
 
 
78 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.977755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0021  tRNA-Asn  91.67 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.503528  normal  0.129544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0076  tRNA-Asn  91.67 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0515739  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60060  tRNA-Asn  94.83 
 
 
73 bp  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.678993  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t11  tRNA-Asn  94.83 
 
 
73 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000006616  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t36  tRNA-Asn  94.83 
 
 
73 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.036377  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23490  tRNA-Asn  94.83 
 
 
73 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00227157  hitchhiker  0.00614087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60180  tRNA-Asn  94.83 
 
 
73 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000682049  hitchhiker  0.0000000115444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0031  tRNA-Asn  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0885898  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t11  tRNA-Asn  90.28 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.75816  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t39  tRNA-Asn  90.28 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.522109  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0076  tRNA-Asn  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509004  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA46  tRNA-Asn  90.28 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00683435  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA9  tRNA-Asn  90.28 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000000314512  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0011  tRNA-Asn  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00131891  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0002  tRNA-Asn  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409498 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0043  tRNA-Lys  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102089  hitchhiker  0.00032415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0067  tRNA-Asn  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.143044  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0035  tRNA-Asn  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0075  tRNA-Asn  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R31  tRNA-Asn  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208957  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0056  tRNA-Asn  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.880886  decreased coverage  0.00985409 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0032  tRNA-Asn  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172004  normal  0.954091 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0024  tRNA-Asn  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0077208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0025  tRNA-Asn  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60180  tRNA-Asn  91.38 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt44  tRNA-Lys  97.62 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.305367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0045  tRNA-Lys  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0394104  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0009  tRNA-Lys  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.538917  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_006368  lppt01  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt01  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0053  tRNA-Asn  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0015  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0014  tRNA-Asn  89.83 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00017  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000192994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00019  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000148305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00020  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000893076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00021  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000923528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00044  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000150882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0031  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115429  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0054  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153086  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0055  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000177997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0056  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000193092  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0058  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0060  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.42893e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5022  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000229653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0068  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000208772  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0772  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175235  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0770  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0036  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000584737  hitchhiker  0.00132337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5020  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000079938  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0817  tRNA-Lys  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000862266  normal  0.885127 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0816  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000928863  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0666  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000300232  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4684  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.3682299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5052  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715976  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5023  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198459  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0073  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623521  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0071  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577417  normal  0.268649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0768  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000959618  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0069  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000622929  normal  0.276829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4661  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00251  tRNA-Lys  89.66 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00376  tRNA-Lys  89.66 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2783  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.45376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0667  tRNA-Lys  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201635  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0583  tRNA-Lys  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.0474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0814  tRNA-Lys  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000653999  normal  0.868526 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0766  tRNA-Lys  89.66 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000107183  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0458  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0067  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000904848  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0031  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282035  normal  0.10093 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0036  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000225732  normal  0.109866 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0038  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000184687  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0039  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375421  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0040  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351036  normal  0.107458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0064  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000662129  normal  0.0840838 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2557  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000373976  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>