19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_R0025 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_R0025  tRNA-OTHER  100 
 
 		 128 bp  254  5.000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0010  tRNA-OTHER  92 
 
 		 117 bp  101  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0033  tRNA-Val  94.83 
 
 		 98 bp  83.8  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0020  tRNA-OTHER  92.42 
 
 		 122 bp  83.8  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.430944  hitchhiker  0.000000157514 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0009  tRNA-Val  100 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0009  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257244  normal  0.321857 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0037  tRNA-Val  100 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0013  tRNA-OTHER  96.88 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.689744 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0009  tRNA-OTHER  96.88 
 
 		 119 bp  56  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0022  tRNA-OTHER  100 
 
 		 130 bp  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0025  tRNA-OTHER  100 
 
 		 122 bp  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0004  tRNA-Thr  100 
 
 		 94 bp  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0010  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0026  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.981984 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0037  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0004  tRNA-OTHER  89.47 
 
 		 105 bp  44.1  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0036  tRNA-Met  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582782  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0045  tRNA-Met  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0038  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.91696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>