41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_641 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_641  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000945354  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0015  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000125426  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Met-2  tRNA-Met  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000219086  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00645597  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_714  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0692708  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0022  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.275054  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0016  tRNA-Met  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000169837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0016  tRNA-Met  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000153982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0083  tRNA-Met  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161068  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0045  tRNA-Met  86.67 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0014  tRNA-Asn  88.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0015  tRNA-Asn  88.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0005  tRNA-Asn  88.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.570068 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0041  tRNA-Met  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000311146  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0005  tRNA-Met  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.245348 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0036  tRNA-Met  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582782  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01505  tRNA-Met  85.71 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.946328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1171  tRNA-Met  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1239  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4572  tRNA-Met  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0033  tRNA-Met  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.404585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0035  tRNA-Met  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.481386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0076  tRNA-Met  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1429  tRNA-Met  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0049  tRNA-Met  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.488702  normal  0.899504 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t27  tRNA-Met  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0037  tRNA-Met  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565757  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0035  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0035  tRNA-Met  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.471041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0028  tRNA-Met  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0034  tRNA-Met  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000103036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0042  tRNA-Met  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000224763  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0500  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00327724  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0531  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1748  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>