112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_R0070 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_R0070  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0320721  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0004  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-3  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0002  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00524383  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0054  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0060  tRNA-Met  97.4 
 
 
76 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0011  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.259096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0011  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167662 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0045  tRNA-Met  96.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000299678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0051  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00732505  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0008  tRNA-Met  92.21 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0076  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0065  tRNA-Met  92.21 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  95 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  95 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  95 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  95 
 
 
74 bp  95.6  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1228  tRNA-Met  91.55 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2151  tRNA-Met  91.55 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0974821  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2266  tRNA-Met  91.55 
 
 
79 bp  93.7  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.507582  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0029  tRNA-Met  91.89 
 
 
73 bp  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.513639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0008  tRNA-Met  90.91 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.745239  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0040  tRNA-Met  90.91 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000293258  hitchhiker  0.00175254 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0026  tRNA-Met  90.91 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.963171  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0018  tRNA-Met  89.47 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555384  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  92.06 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  92.06 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  92.06 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  92.06 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0217  tRNA-Met  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000283281  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0044  tRNA-Met  89.61 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.477154  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0074  tRNA-Met  95.92 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0033  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507086  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0026  tRNA-Met  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0211929  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0033  tRNA-Met  89.19 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0018  tRNA-Met  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0083  tRNA-Met  88.31 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161068  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0011  tRNA-Met  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0009  tRNA-Met  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.349151  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0390  tRNA-Met  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1788  tRNA-Met  87.01 
 
 
79 bp  73.8  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0074  tRNA-Met  93.88 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565222  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0008  tRNA-Met  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0008  tRNA-Met  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0077  tRNA-Met  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1239  tRNA-Met  87.32 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-3  tRNA-Met  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0052  tRNA-Met  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0052  tRNA-Met  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.52519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0034  tRNA-Met  91.84 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.029342  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0055  tRNA-Met  87.01 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0023  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00191996  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0029  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00945673 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0002  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.452925 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0040  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.138957  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0036  tRNA-Met  91.84 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582782  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0027  tRNA-Met  87.3 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt37  tRNA-Met  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt37  tRNA-Met  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0035  tRNA-Met  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0001  tRNA-Met  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0001  tRNA-Met  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.764109  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R17  tRNA-Met  87.72 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0015  tRNA-Met  93.33 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.012371 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  87.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0964  tRNA-Met  89.58 
 
 
77 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0491752  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0031  tRNA-Lys  96.88 
 
 
76 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282035  normal  0.10093 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt02  tRNA-Asn  87.93 
 
 
76 bp  52  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00232285  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0001  tRNA-Met  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.103849  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0012  tRNA-Lys  85.71 
 
 
76 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0013  tRNA-Lys  87.93 
 
 
76 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0037  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0076  tRNA-Met  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607006 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0046  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56925  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0053  tRNA-Met  85.96 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.157606  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0053  tRNA-Met  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.568663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0005  tRNA-Met  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0075  tRNA-Met  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0008  tRNA-Met  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0035  tRNA-Met  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14010  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.5197900000000005e-29  hitchhiker  0.00000218177 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0006  tRNA-Met  88.89 
 
 
73 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0204099  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0090  tRNA-Met  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0020  tRNA-Met  85.96 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235412  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0042  tRNA-Met  89.8 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t27  tRNA-Met  87.5 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt021  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000111165  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0744  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0044  tRNA-Lys  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0045  tRNA-Lys  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0394104  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0030  tRNA-Lys  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00181999  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0031  tRNA-Ser  93.75 
 
 
71 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0049  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.488702  normal  0.899504 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0565  tRNA-Met  86.54 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0744  tRNA-Met  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1429  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0028  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0020  tRNA-Lys  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0005  tRNA-Met  84.13 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R85  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000392711  normal  0.139557 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>