55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_R17 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_R17  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0002  tRNA-Met  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00524383  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-3  tRNA-Met  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0011  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.259096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0011  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167662 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0054  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0074  tRNA-Met  87.67 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0051  tRNA-Met  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00732505  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0009  tRNA-Met  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.349151  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0008  tRNA-Met  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.745239  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0033  tRNA-Met  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0004  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0070  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0320721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0077  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0008  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0008  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0074  tRNA-Met  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224698  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0045  tRNA-Met  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0045  tRNA-Met  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000299678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0034  tRNA-Met  84.93 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.029342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0060  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0052  tRNA-Met  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.52519  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2266  tRNA-Met  87.5 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.507582  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-3  tRNA-Met  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2151  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0974821  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0052  tRNA-Met  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1228  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0057  tRNA-Asn  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000258126  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0026  tRNA-Met  85.07 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0211929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0084  tRNA-Asn  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000101082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0042  tRNA-Asn  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213291  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0029  tRNA-Met  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.513639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0040  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000293258  hitchhiker  0.00175254 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0033  tRNA-Met  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0007  tRNA-Met  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0052  tRNA-Asn  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.274445  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0032  tRNA-Asn  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118975  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0006  tRNA-Met  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0204099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0007  tRNA-Met  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0744  tRNA-Met  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0033  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0049  tRNA-Met  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.404758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0007  tRNA-Met  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.860787  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0076  tRNA-Met  83.78 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0744  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt021  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000111165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>