50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_R0033 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_R0033  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0029  tRNA-Met  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.513639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0040  tRNA-Met  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000293258  hitchhiker  0.00175254 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0051  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00732505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0060  tRNA-Met  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0008  tRNA-Met  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.745239  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-3  tRNA-Met  89.19 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0002  tRNA-Met  89.19 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00524383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0004  tRNA-Met  89.19 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0054  tRNA-Met  89.19 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0070  tRNA-Met  89.19 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0320721  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0008  tRNA-Met  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0009  tRNA-Met  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.349151  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0076  tRNA-Met  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0011  tRNA-Met  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0011  tRNA-Met  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.259096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0045  tRNA-Met  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000299678  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0065  tRNA-Met  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0026  tRNA-Met  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.963171  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0018  tRNA-Met  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555384  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0044  tRNA-Met  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.477154  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0033  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0034  tRNA-Met  86.3 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.029342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0015  tRNA-Met  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.012371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0026  tRNA-Met  85.14 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0211929  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0009  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249848  normal  0.901496 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0042  tRNA-Met  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0055  tRNA-Met  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0035  tRNA-Met  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0013  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000227185  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0016  tRNA-Met  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000169837  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0041  tRNA-Met  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000311146  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R17  tRNA-Met  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0016  tRNA-Met  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000153982  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0008  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0083  tRNA-Met  86.21 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0008  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0077  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0042  tRNA-Met  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000224763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0034  tRNA-Met  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000103036  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0565  tRNA-Met  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>