299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0217 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0217  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000283281  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1788  tRNA-Met  93.24 
 
 
79 bp  107  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0390  tRNA-Met  93.24 
 
 
77 bp  107  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0026  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0211929  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0018  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0040  tRNA-Met  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.138957  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0022  tRNA-Met  96.43 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164411  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-3  tRNA-Met  90.54 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0011  tRNA-Met  90.54 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt37  tRNA-Met  90.54 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt37  tRNA-Met  90.54 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0002  tRNA-Met  90.54 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00524383  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0011  tRNA-Met  90.54 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167662 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0023  tRNA-Met  90.54 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00191996  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0011  tRNA-Met  90.54 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.259096  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0051  tRNA-Met  93.22 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.430637  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0046  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00275873  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0002  tRNA-Met  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.452925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0051  tRNA-Met  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00732505  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0070  tRNA-Met  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0320721  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0004  tRNA-Met  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0054  tRNA-Met  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0043  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.314708 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t099  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0187022  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t023  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0036  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0559117  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0120  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0737074  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0120  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000419542  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0117  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000129359  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0032  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0772174  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0025  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000863723  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0024  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00918004  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0046  tRNA-Met  90.62 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00480541  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0005  tRNA-Met  92.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00829837  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2266  tRNA-Met  90.48 
 
 
79 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.507582  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2151  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0974821  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1228  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0003  tRNA-Met  92.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.879602  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0001  tRNA-Met  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.764109  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Met-3  tRNA-Met  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121443  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0001  tRNA-Met  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0076  tRNA-Met  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0035  tRNA-Met  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0092  tRNA-Met  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0084  tRNA-Met  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0304  tRNA-Met  91.07 
 
 
79 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.150543  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0015  tRNA-Met  89.06 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000155913  normal  0.449065 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4209  tRNA-Met  91.07 
 
 
79 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00407294  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0024  tRNA-Met  89.06 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000329716  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4332  tRNA-Met  95.35 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  89.83 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0053  tRNA-Met  88.06 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.568663 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0033  tRNA-Met  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000189228  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0060  tRNA-Met  87.84 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0032  tRNA-Met  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136069  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0045  tRNA-Met  87.84 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000299678  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0012  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07711  tRNA-Met  97.37 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0018  tRNA-Met  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555384  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0571  tRNA-Met  92 
 
 
80 bp  67.9  0.0000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0020  tRNA-Met  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235412  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0022  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0041  tRNA-Met  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00042704  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0039  tRNA-Met  87.5 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067349  normal  0.10104 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t30  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00107522  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0033  tRNA-Met  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507086  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0028  tRNA-Met  87.5 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0008  tRNA-Met  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0008  tRNA-Met  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0077  tRNA-Met  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet02  tRNA-Met  89.29 
 
 
80 bp  63.9  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0016  tRNA-Met  87.5 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00509711  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt20  tRNA-Met  97.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0025  tRNA-Met  85.14 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131136  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t02  tRNA-Met  85.14 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA75  tRNA-Met  85.14 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R95  tRNA-Met  85.14 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0007  tRNA-Met  87.93 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0029  tRNA-Met  86.49 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.513639 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0008  tRNA-Met  86.49 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0031  tRNA-Lys  86.49 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282035  normal  0.10093 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0040  tRNA-Met  86.49 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000293258  hitchhiker  0.00175254 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  85.94 
 
 
77 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.617808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0104  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.013625  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0046  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216228  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0114  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00121971  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0019  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.682883  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0018  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0278993  normal  0.0571882 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0028  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0021  tRNA-Met  85.94 
 
 
74 bp  56  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00425805  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0055  tRNA-Met  94.29 
 
 
74 bp  54  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4303  tRNA-Met  94.29 
 
 
77 bp  54  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0012  tRNA-Met  94.29 
 
 
77 bp  54  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>